Dette dokument beskriver indholdet af zip-filen. Variabelnavnene, som beskrives nedenfor, refererer til søjlenavne medmindre andet er beskrevet. 

BEMÆRK:
Fra fredag d. 31. marts 2023 indstilles alle filer i denne zip. Det betyder, at filerne fra denne dato ikke længere opdateres. Der henvises i stedet til SSI's regionale covid-19-dashboard for alternative visninger. Data bag kan findes her: 'https://covid19.ssi.dk/overvagningsdata/download-fil-med-overvaagningdata', under "Filer med covid-19-opgørelser fra dashboarded (zip-csv)". 
Data om fordeling af varianter og covid-19 på plejehjem kan fra onsdag d. 5. april 2023 og fremadrettet findes i samme placering som angivet ovenfor.

Fra mandag d. 13. februar 2023 er der foretaget en justering i datagrundlaget for visningen ’nyindlæggelse pga. eller med covid-19’, da der var medregnet indlæggelser under 12 timer, som ikke skulle medregnes i denne klassifikation. Der var tale om en algoritmefejl, der siden starten af 2022 har overestimeret antallet af nyindlæggelser, som klassificeres. Dette er nu korrigeret, så de ikke længere tælles med i datagrundlaget.

Den 9/5-2022 er en overestimering af antal testede personer blevet korrigeret i "Fil 7: Test_pos_over_time". Overestimeringen har ikke haft betydning for beregningen af positivprocenterne i filen. Siden den 23. marts 2022, hvor reinfektioner blev implementeret i zip-filen med overvågningsdata, har antallet af testede personer i kolonnerne PrevPos, Tested og Tested_kumulativ i filen Test_pos_over_time været overestimeret. 

Fra d. 23/3-2022 indeholder filerne reinfektioner. Dog kører gennembrudsinfektionsfiler (se senere sektion) videre på en tidligere algoritme, som beregnede reinfektioner lidt anderledes i nogle filer og slet ikke i andre.

Fra d. 23/3-2022 udgår Cases_by_age og Municipality_test_pos fra zip-filen.


Forkortelser:
LPR: Landspatientregistret.
CPR-registret: Det Centrale Personregister.




Generelle definitioner:
Dødsdato: Dagen hvor en person er registreret død.
Covid-19-relateret indlæggelse: En indlæggelse, hvor patienten blev indlagt inden for 14 dage efter prøvetagningsdato for den første positive SARS-CoV-2-PCR-prøve. Data baseres på de daglige øjebliksbilleder fra regionernes IT-systemer, som sendes hver dag kl. 7 og 15 og Landspatientregistret (LPR). Indlæggelser omfatter patienter, der har været registreret i mindst ét øjebliksbillede, eller som ifølge LPR er eller har været indlagt mere end 12 timer. Indlæggelser registeret i LPR på intensivafdeling inkluderes også når de varer mindre end 12 timer.
Covid-19-relaterede indlæggelsesdatoer: Indlægges en person mere end 48 timer før deres første positive PCR-test for Covid-19 er taget, så tæller deres prøvetagningsdato som COVID-19-indlæggelsesdatoen. I alle andre tilfælde er det indlæggelsesdatoen, som er angivet.
Prøvedato: Dette er datoen PCR-testen blev taget og ikke datoen, hvor prøvesvaret forelå.
Befolkningstal: Befolkningstal er baseret på CPR-registeret og opdateres d.15 i hver måned. Populationen udgøres af personer i live som har et gyldigt CPR nummer, er bosat i Danmark og opfylder følgende kriterier: Personen skal have en gyldig kommunekode, som matcher en eksisterende kommune, køn skal være angivet og personen skal have en gyldig vejkode. 




Generel struktur:
Rækkerne i filerne er som udgangspunkt stratificeringer efter relevante parametre, eksempelvis aldersgruppering eller tidsopdeling. Der stratificeres generelt efter variablen i første søjle. Mange filer indeholder også en række, som opgiver totalen. Enkelte tabeller kan have rækker, som afviger fra dette mønster. I disse tabeller specificeres dette i "Noter" under tabellens variabelbeskrivelse. Filerne er semikolon-separerede.

Filerne bliver opdateret hver dag og i denne forbindelse kan tidsserier også ændre sig tilbage i tiden, hvis nyere data foreligger. Derfor anbefales det altid at benytte det senest tilgængelige data og for så vidt muligt, ikke at gemme filer og lave tidsserier på basis af gamle filer.

Typer af tests:
Filerne bygger som udgangspunkt på PCR-test, som er den test, der bruges til at definere bekræftede covid-19-tilfælde. Antigen-test (også kaldet for lyntest, kviktest, ag-test og hurtigtest) anvendes i teststrategien som screeningsværktøj og bruges i overvågningen til at definere mistænkte tilfælde. Der er nogle filer, som viser data for antigen-tests, hvis andet ikke er angivet bygger filen på PCR-tests. Data indeholder ikke serologitest, som er den test, der udføres, når man skal undersøge, om raske mennesker tidligere har haft covid-19.

------------------------------------------------------

Fil 1: Cases_by_sex:

Aldersgruppe: Aldersgrupperingerne som bekræftede tilfælde er stratificeret efter.
Kvinder_(procent): Antallet af kvinder i den givne aldersgruppe, som er testet positive for covid-19. Tallet i parentes er procent af totalen for denne aldersgruppe, som er kvinder, og kan udregnes som tallet før parentesen i Kvinder_(procent) divideret med værdien i I_alt i samme række.
Mænd_(procent): Antallet af mænd i den givne aldersgruppe, som er testet positive for covid-19. Tallet i parentes er procent af totalen for denne aldersgruppe, som er mænd, og kan udregnes som tallet før parentesen i Mænd_(procent) divideret med værdien i I_alt i samme række.
I_alt: Alle bekræftede covid-19-tilfælde i den givne aldersgruppe. Udregnes som summen af tallene for kvinder og mænd.

------------------------------------------------------

Fil 2: Deaths_over_time:

Dato: Datoer i formatet YYYY-MM-DD, som der stratificeres efter.
Antal_døde: Antal døde registreret på en given dag. En person indgår, hvis de er registreret i enten CPR eller Dødsårsagsregisteret. Er en person registreret både i CPR og Dødsårsagsregisteret med forskellige dødsdatoer, bruges datoen angivet i CPR. Dødsfald relateret til covid-19 defineres som et covid-19 bekræftet tilfælde, der er død indenfor 30 dage efter påvist covid-19-infektion. Covid-19 er ikke nødvendigvis den tilgrundliggende årsag til dødsfaldet.

------------------------------------------------------

Fil 3: Deaths_o_weeks_covid_cause:

Dato: Kalenderuge-år i formatet Uuu-YYYY 
Ugentlig antal døde som i Fil 2 og yderligere stratificeret efter tilgrundliggende dødsårsag (baseret på ugentlige opgørelser af Dødsårsagsregisterets løbende validering af Covid-19-relaterede dødsattester, leveret af Sundhedsdatastyrelsen).
Se den ugentlige tendensrapport covid19.ssi.dk for yderligere beskrivelser og figurer.

------------------------------------------------------

Fil 4: Municipality_cases_time_series: 

Dette er en krydstabel over antallet af bekræftede covid-19-tilfælde for kommunerne på en given dag. Kolonnenavne angiver kommunen, og rækkenavne angiver testdatoen. Cellerne indeholder antallet af bekræftede covid-19-tilfælde for en given kombination af kommune og testdato.

------------------------------------------------------

Fil 5: Municipality_tested_persons_time_series: 

Dette er en krydstabel over antallet af personer, som er testede for covid-19 for kommunerne på en given dag. Kolonnenavne angiver kommunen, og rækkenavne angiver testdatoen. Cellerne indeholder antallet af testede personer for en given kombination af kommune og testdato. En person kan bidrage op til en gang hver dag, såfremt de ikke tidligere er testet positive.

------------------------------------------------------

Fil 6: Newly_admitted_over_time:

Indlæggelsestal i denne tabel er baseret både på LPR og de daglige øjebliksbilleder, som indrapporteres af regionerne hver dag, og en person medregnes, når blot de er registreret indlagt i en af disse. Er en person registreret i begge med forskellige datoer, så bruges den første. Denne opgørelse er udelukkende baseret på covid-19 bekræftede tilfælde. Læs mere om definitionen for covid-19 relateret indlæggelse på Datakilder og definitioner (ssi.dk)

Dato: Datoer i formatet YYYY-MM-DD som der stratificeres efter.
Hovedstaden: Antal nyindlagte på en given dag i Region Hovedstaden.
Sjælland: Antal nyindlagte på en given dag i Region Sjælland.
Syddanmark: Antal nyindlagte på en given dag i Region Syddanmark.
Midtjylland: Antal nyindlagte på en given dag i Region Midtjylland.
Nordjylland: Antal nyindlagte på en given dag i Region Nordjylland.
Ukendt Region: Antal nyindlagte på en given dag, som ikke har en registreret bopæl i nogen region.
Total: Det totale antal nyindlagte på en given dag, dette tal er summen af værdierne i Hovedstaden, Sjælland, Syddanmark, Midtjylland, Nordjylland og Ukendt Region.

------------------------------------------------------

Fil 7: Test_pos_over_time: 

Tabellen indeholder kun personer testet ved PCR-test. 
Denne tabel fokuserer på testede personer per dag frem for personer testet i hele perioden. I modsætning til de andre tabeller kan en person derfor bidrage flere gange til denne tabel, dog kun en gang per dag.

Dette er modsat dashboardet (www.ssi.dk/covid19data), hvor positivprocenten beregnes over en uge, med antal personer som er testet positive seneste syv komplette dage over antallet af alle personer testet seneste syv komplette dage.

Date: Datoer i formatet YYYY-MM-DD som der stratificeres efter.
NewPositive: Antallet af personer, som for første gang er testet positive for covid-19, på en given dag. Hvis det er en reinfektion skal der være gået mindst 60 dage siden starten af forrige infektion for at en person tælles med i denne kategori.
NotPrevPos: Antallet af personer testet på en given dag, hvor sidste infektion ligger mere end 60 dage tilbage i tiden. Indeholder negative tests for personer, som ikke har testet positive før, samt den første positive test for hver infektion.
PosPct: Andelen (%) af personer som er testet positive. Dette er beregnet som NewPositive divideret med NotPrevPos. 
PrevPos: Antallet af personer testet på en given dag, som tidligere har testet positive hvor sidste infektion ligger indenfor de sidste 60 dage. Den positive test som indikerer infektionsstart indgår ikke her.
Tested: Det samlede antal testede personer på en given dag, som har fået konklusivt svar (positiv eller negativ). Dette kan udregnes som NotPrevPos plus PrevPos.
Tested_kumulativ: Det kumulerede antal personer testet op til og med en given dag, som har fået konklusivt svar (positiv eller negativ). Udregnes som summen af værdierne i Tested frem til den givne dag. En person, der er testet på flere forskellige dage, kan bidrage mere end en gang i denne sum.

Noter: I den sidste række (Antal personer) er den totale opgørelse opgjort således, at en person kun kan indgå en gang i hver søjle, i modsætning til de andre. Af denne grund er Tested det samme som NotPrevPos i denne række, og ikke en sum af NotPrevPos og PrevPos, som i de andre.

------------------------------------------------------

Fil 8: plejehjem_ugeoversigt:

OBS: Kommer kun ud om tirsdagen. 
Denne fil indeholder en opgørelse over covid-19-tests og -tilfælde på danske plejehjem pr. uge siden uge 11 2020. Dette er dataen bag tabel 7.1, som dog kun indeholder de seneste fem uger. 

År: Årstal, der stratificeres efter.
Uge: Uge, der stratificeres efter. 
Bekræftede tilfælde beboere: Antal beboere på plejehjem, som er testet positiv for covid-19 med en PCR test inden for den givne uge. Alle personer tæller kun med med deres første positive test.
Dødsfald blandt bekræftede beboere: Antal beboere på plejehjem, som er døde i den givne uge, hvis det er inden for 30 dage, efter at de er testet positiv for covid-19 med en PCR-test for første gang. 
Plejehjem med bekræftede beboere: Antal plejehjem, hvor mindst én beboer er testet positiv for covid-19 med en PCR-test inden for den givne uge. Igen tæller kun beboernes første positive test.
Antal tests blandt beboere: Antal PCR-tests for covid-19 udført på beboere på plejehjem inden for den givne uge. Hver beboer kan tælle med flere gange. Beboere, som tidligere er testet positive, tæller fortsat med, hvis de bliver testet igen senere (uafhængigt af resultat).
Plejehjem med testede beboere: Antal plejehjem, hvor mindst én beboer er blevet PCR-testet for covid-19 inden for den givne uge.


------------------------------------------------------

=============== Indlæggelse af og med covid-19 =======

Filen indeholder data bag figur 7 i den ugentlige tendensrapport:
https://covid19.ssi.dk/overvagningsdata/ugentlige-tendenser-for-covid-19-og-andre-luftvejsinfektioner

Nyindlæggelse: Den første Covid-19-relateret indlæggelse registreret efter den første positive SARS-CoV-2-PCR-prøve.

------------ figurtendensugedata ---------------------

Denne fil indeholder en opgørelse over andelen af Covid-19 relaterede nyindlæggelser i tre grupper,"Indlæggelse pga. covid-19", "Indlæggelse, hvor covid-19 kan have spillet en rolle" og "Indlæggelse pga. andre forhold end covid-19", stratificeret på uge. Opgørelsen er for perioden 01-06-2020 frem til og med søndag to uger før udgivelse af tendensrapporten.
Detaljer vedrørende klassifikation af nyindlæggelser i de tre grupper kan findes i fokusrapporten om covid-19-relaterede hospitalsindlæggelser under SARS-CoV-2-epidemien. (https://www.ssi.dk/aktuelt/nyheder/2022/tre-ud-af-fire-indlagte-pa-hospitalerne-med) 

uge: Uge som den covid-19 relaterede indlæggelser er påbegyndt i.
år: År som den covid-19 relaterede indlæggelser er påbegyndt i.
Klassifikation: Klassifikation af nyindlæggelser ud fra diagnoser givet under indlæggelsen. 
Antal nyindlæggelser: Antallet af nyindlæggelser for den givne uge og klassifikation.
Fordeling af nyindlæggelser [%]: Fordelingen af nyindlæggelser i procent for den givne dag og klassifikation.

------------------------------------------------------

=============== Variant data for covid19 =======

------------ Variant_tabel.xlsx ---------------------

Data for den seneste uge trækkes på udarbejdelsesdatoen. Data opdateres løbende bagudrettet i takt med, at resultater fra sekventering bliver tilføjet. Data er opgjort på prøvedato, og derfor kan der være nogle prøver fra den seneste uge, der endnu ikke er indkommet svar for.

------------------------------------------------------

========= Gennembrudsinfektionsfiler =================

Fra og med tirsdag den 3. maj 2022 er ’Gennembrudsfilerne’ ikke længere en del af zip-filen med overvågningsdata om tirsdagen. Gennembrudsfilerne er blevet offentliggjort på ugentlig basis i en tidsperiode under covid-19-epidemien med stort fokus på gennembrudsinfektioner samt indlæggelse og død opgjort på vaccinestatus. På nuværende tidspunkt er disse oplysninger ikke længere af væsentlig og samfundskritisk betydning, hvorfor filerne udfases. 
